Trường THPT Phạm Phú thứ thành lập theo Quyết định số 3196/QĐ-UBND ngày 20/6/2017 của Ủy ban Nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh.
Từ những ngày đầu thành lập, trường THPT Phạm Phú Thứ đã luôn nỗ lực, phấn đấu, nâng cao chất lượng giáo dục của nhà trường. Cùng với những hoạt động khác, công tác Kiểm định chất lượng Giáo dục luôn được chú trọng.
Kết quả kiểm định chất lượng giáo dục đã giúp cải tiến, duy trì và nâng cao chất lượng các hoạt động giáo dục trong nhà trường. Và trong năm học 2021-2022, trường THPT Phạm Phú Thứ đã vinh dự được nhận Giấy chứng nhận Trường đạt Kiểm định chất lượng Giáo dục Cấp độ 1.
Tập thể Hội đồng sư phạm nhà trường tin rằng bằng sự đồng lòng, đoàn kết, không ngừng học hỏi, trau dồi chuyên môn, trường THPT Phạm Phú Thứ sẽ là môi trường học tập an toàn, thân thiện, hiệu quả cho các thế hệ học sinh tương lai.
